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细胞DNA提取试剂的选择

来源:www.baiyundou.net   日期:较早时间
       从细胞或组织中提取核酸进行分子生物学研究或基因检测已经成为现代医学诊断以及科学研究的一种重要手段。原理不必多说,做过相关实验的小伙伴应该都知道,那就是将细胞膜破裂,变性膜蛋白以及核蛋白,释放出核酸,然后再将核酸提取纯化出来。

       众所周知,细胞、组织DNA提取的主流方法主要有磁珠法和离心柱法。关于这两种方法的优劣想必大家在很多资料中已经有所了解,磁珠法针对大批量样本,可自动化作业,但提取的DNA纯度低,得率也较低,而且容易引发交叉污染,导致假阴性检测结果;离心柱法适合手动提取或半自动化提取,工作效率低一些,但提取的DNA纯度较高,得率也较高。

       如果样本不是太多或者样本比较珍贵,而且实验对DNA提取结果要求比较高,个人建议最好采用离心柱法。那么,面对种类繁多的离心柱法试剂盒,我们应该如何选择?接下来我们就看一下有哪些因素需要考虑。

        一、较高的DNA提取得率。对离心柱法而言,细胞DNA提取得率的高低主要取决于离心柱对核酸的吸附能力、洗脱能力以及裂解液的裂解消化能力。离心柱的硅胶膜DNA吸附性能好、裂解液裂解能力强、洗脱液洗脱能力好,核酸的提取得率就高。反之,DNA的提取得率就不高。我们可以采用紫外分光光度法进行DNA提取得率的测定,但是不能作为判断得率的唯一标准,最好还是要做个PCR或荧光定量。细胞数量与提取的核酸量成正比,如果要提高核酸得率,可通过增加细胞量来实现。一般先提取105-106的细胞量(最好不超过107 Cell,可用细胞计数方法进行细胞计数),如结果不理想可考虑增加细胞量。但如果增加细胞量还不能得到满意结果,应及时考虑更换试剂盒。目前国内常用的细胞DNA提取试剂有国外品牌Q,国产品牌Biog和T等。根据我们的经验,Q细胞DNA的提取得率,一般107细胞样本在40-60ug。Biog与Q公司的DNA提取得率相近,106-107细胞样本在30-60ug;T公司 106-107细胞样本DNA得率在20-50ug,都能满足下游PCR实验的要求。

       二、DNA提取纯度高。我们一般采用紫外分光光度法测定OD260/OD280比值来估计核酸纯度。一般DNA 溶液OD260/OD280比值应在1.6--1.8之间,如果提取的DNA溶液该比值小于1.6,通常说明有蛋白质或酚、多糖等的污染。如果提取的DNA溶液该比值大于1.9,则表明有RNA污染。不同品牌的试剂盒提取的DNA纯度略有差别,国产试剂盒Biog和T的DNA提取纯度差不多,都可以直接应用于基因检测、PCR、qPCR、分子杂交等。Q的纯度略高,一般在1.7-1.9,除了以上应用,还可用于对纯度要求略高的实验,如二代测序等。

        三、产品价格。市面上的试剂盒价格参差不齐,各个实验室的经费情况也不尽相同,所以价格也是客户选购产品的重要因素。对于绝大多数实验如PCR、qPCR、基因检测、分子杂交等,国产试剂盒都能满足质量要求。与国外知名品牌相比,国产试剂盒的价格较为便宜,一般只有国外品牌价格的30%,性价比较高。因而,对于以上实验建议选用Biog、T等国产试剂盒。对于经费不多的课题研究或样本量较大的临床检测项目,建议选用国产试剂盒。对提取DNA的纯度要求相对较高的研究如直接测序,细胞转染等,则可考虑Q等国外知名品牌。

        综上三点,与国外知名品牌相比,国产试剂盒在细胞DNA提取纯度上略有不足,但不影响大多数实验,特别是下游PCR扩增以及分子杂交类实验;在DNA提取得率上,国内试剂盒与国外品牌差别不大;而在价格方面,国产试剂盒具有比较明显的优势。如果经费充足,DNA纯度要求较高,可考虑选择Qiagen等国外知名品牌。如果经费不多或下游做PCR、qPCR、分子杂交等实验,可考虑选择性价比较高的Biog等国产品牌。

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相关要点总结:

18196616641:DNA与RNA鉴别与提取是所需要用到的试剂
能谢答:常规的鉴定包括:1. 凝胶电泳鉴定DNA或RNA大小是否正确,样品是否有降解等;需要的试剂包括琼脂糖,EB或其他核酸染料,DNA/RNA Marker。当然还需要配套的仪器。2. 紫外分光光度计检测DNA或RNA的浓度和纯度;这个不需要特别的试剂,但需要紫外分光光度计,一般检测OD260与OD280的吸光值。

18196616641:如何选择合适的全血DNA提取方法
能谢答:医院的血液标本一般在2ml以上,一般选择溶液型的方法提取.在说到国产和 进口差别的时候,很多人以为进口一定比国产的好,我们觉得没有最好,只有更好!在不断的进行试验优化之后,全血基因组dna提取试剂盒DP2101或 DP2201开创了第三代技术,不需要蛋白酶K消化,进口的都是要借助蛋白酶K的啊!DP2101或DP...

18196616641:有关实验“DNA的提取及检测”的问题
能谢答:第一次,在溶解核内DNA时,加入NACL后充分搅拌,加速染色质中DNA与蛋白质的分离,使DNA充分游离并融入NACL中 第二次在DNA粘稠物在溶解时,家NACL是使DNA再溶解 第三次是在DNA的鉴定中,目的是溶解DNA 3、过滤3次 第一次在提取血细胞核物质时进行过滤,取得的滤液中含有染色质,而滤出的是细胞膜、...

18196616641:提取完dna后,需要进行琼脂糖电泳,那么需要配制或购买哪些试剂
能谢答:需要琼脂糖,电泳缓冲液,核算染料即可。当然还需要有电泳仪,扫胶仪等设备。

18196616641:DNA提取过程中的关键步骤及注意事项有哪些
能谢答:3、 各操作步骤要轻柔,尽量减少DNA的人为降解。4、 取各上清时,不应贪多,以防非核酸类成分干扰。5、 异丙醇,乙醇.NaAc,KAc等要预冷,以减少DNA的降解,促进DNA与蛋白等的分相及DNA沉淀。6、 提取DNA过程中所用到的试剂和器材要通过高压烤干等办法进行无核酸酶化处理。7、 所有试剂均用高压灭菌双...

18196616641:基因组DNA提取中细胞裂解液怎么配制
能谢答:Aprotinin(蛋白酶抑制剂),5 μg/ml Leupeptin(蛋白酶抑制剂),1% Triton x-100(破坏细胞),1% Sodium deoxycholate(中度变性剂和蛋白溶解剂),0.1% SDS(强变性剂和蛋白溶解剂).7M 尿素,2M硫脲(可以提高膜蛋白的融解),蛋白酶K等.建议直接买试剂盒提取DNA,简单快速,成功率又高,省得麻烦 ...

18196616641:请教:细菌DNA的提取
能谢答:一、水煮模板法——主要用于PCR反应 操作最简便,对试剂条件要求低。缺点是纯度不够高,可能会含有RNA、蛋白等杂质。但是作为一般检测目的的PCR反应模板已经足够了。二、CTAB/NaCl 法 CTAB/NaCl法提取的DNA纯度较高,蛋白杂质较少,保存时间长,编者更喜欢把终浓度为20μg/ml RnaseA加在第5步温育的...

18196616641:高中生物DNA分子的提取详细步骤?
能谢答:2.取出准备好的鸡血细胞液5-10ml,注入到50ml烧杯中,并向烧杯中加入20ml蒸馏水(使红细胞吸水胀破),搅拌5分钟。用垫有纱布的漏斗过滤,取其滤液。3.去物质的量浓度为2mol/L的氯化钠溶液40ml加入滤液中,用玻璃棒沿一个方向轻轻搅拌,使其混合均匀。4.取适量蒸馏水(降低氯化钠溶液的浓度,使DNA...

18196616641:请问组织/细胞基因组DNA提取试剂盒都有啥特点?
能谢答:博凌科为的组织/细胞基因组DNA提取试剂盒采用高效缓冲液对样品进行裂解,DNA与硅胶膜特异性结合,经过漂洗,蛋白质和其他杂质被最大限度除去,实验过程中不需酚、氯仿等毒性有机溶剂抽提和乙醇沉淀等步骤,提取的DNA纯度高,适用于PCR、酶切等下游试验。试剂盒特点:· 采用进口硅胶膜,基因组DNA得率高,...

18196616641:提取贴壁细胞的DNA一定要用蛋白酶K和RNaseA吗
能谢答:而且提取的DNA中容易出现蛋白污染,不加RNaseA的话可能会导致提取的DNA中残留有RNA。2、提取贴壁细胞的方法很多,你用PBS洗涤一下细胞,然后刮下来或者用酶消化细胞后离心收集之后就可以用随便什么方法提取了,说的那种方法可靠的,嫌麻烦的话就用试剂盒,比如天根的血液组织细胞基因组提取试剂盒(DP304)

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